Если вы хотите иметь монокультуру в стерильных условиях, то отберите немного червей и коконов, промойте, пересадите в новый, стерильный субстрат и... скорее всего питомцы загнутся. Им нужна стабильность. Менять влажность, температуру, субстрат и еду можно, но очень медленно, постепенно, всегда оставляя червю выбор между старыми и новыми условиями. Пробуйте, экспериментируйте, воспитывайте собственное сообщество червей, заточенных не на навоз продавца, а под ваши условия.
Основную часть левых пассажиров можно вывести, присыпая поверхность чем-то непитательным для них (гумус, бумага из шредера), но не герметичным. Можно на поверхности оставлять на бумажке приманку с ядом или ленту от мух. Привыкайте к работе с говном. Это только поначалу брезгливо, потом втянитесь и по уши окунетесь.